Sistem akademik yang dilaksanakan di SMAN 3 Unggulan Kayuagung secara garis besar terbagi menjadi 3 yaitu :
1. Intrakurikuler
Merupakan kegiatan inti dari penyelenggaraan pendidikan di SMAN 3 Unggulan Kayuagung. Didalamnya dilaksanakan pendidikan dengan Kurikulum 2013 sebagai acuan yang mencakup 3 ranah yaitu pengetahuan, keterampilan dan sikap.
2. Ekstrakurikuler
Merupakan kegiatan tambahan bagi peserta didik untuk mengembangkan minat dan bakat peserta didik. Dalam pelaksanaanya ekstrakurikuler terbagi menjadi berbagai bidang sesuai dengan sumber daya yang miliki sekolah.
3. Kokurikuler
Merupakan kegiatan pendidikan yang berperan sebagai pendamping intrakurikuler dan ekstrakurikuler. Dalam pelaksanaanya kokurikuler berupa studi banding, pengalaman lapangan maupun kunjungan pada dunia usaha dan industri.